Donkey Kong ha comenzado a notar que su reserva de bananas ha disminuido, lo que es de preocuparse, pues esto se debe a que alguien está detrás de todo esto.
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La historia comienza cuando un grupo de Tikis integran una maligna organización conocida como la tribu Tiki Tak, y que bajo un poder hipnótico comienza a controlar a los animales de la Isla DK para robar los plátanos de Donkey Kong.
Como esto es algo que afecta al protagonista de Donkey Kong Country Returns, emprende un viaje y una lucha para recuperar su reserva de alimentos con la ayuda de Diddy Kong.
En esta ocasión los distintos tipos de Tikis tomarán el papel de los antagonistas de este tiempo, en sustitución del Kremlings, que no aparecerá en el juego. Cranky Kong, el propietario de tiendas en toda la isla, es el único miembro de la familia Kong, que aparecerá en este nuevo título de Donkey Kong.
En cuanto al modo de juego cabe decir que los jugadores tomarán el control de Donkey Kong y Diddy Kong. Muchos elementos tradicionales de la serie Donkey Kong Country regresarán, incluidos los niveles de carrito de la mina, los balanceos de liana en liana, la recolección de plátanos, y las letras de oro «Kong». También habrá niveles con los personajes y entornos en primer plano que aparecerán como siluetas, generando nuevas mecánicas de juego.